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* BaseInstall -- 우분투에 BASE 설치하기. * [http://opensource.microarray.omrf.org/wiki/bin/view/BASE/BASEdBUsersGuide UsersGuide] * http://www.lcb.uu.se/baseplugins.php -- R과 연동이 가능한 plug-in을 제공 |
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| ''제가 실험실에 셋팅하고자 하는 시스템의 벤치마커로 생각하고 있습니다.'' -- ["terra19"] ---- === Tips === 1. plug-in의 application software가 실행되지 않을때 |
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| {{{ vi /usr/local/base/config.inc.php $config["mysql.localinfile"]=0;에서 0을 1로 바꾼다. /usr/local/base/bin/base.server start }}} 2. reporter format이나 result file format의 column내용을 변경하고 싶을 때 : install을 하기 전에 base/include/local을 보면 raw_colums.inc.php와 repoter_columns.inc.php가 있는데, result file은 raw_colums.inc.php를 reporter format은 reporter_columns.inc.php의 내용을 보고 변경을 한 후 install을 수행한다. |
많은양의 MicroArray실험을 관리하면서 분석을 할수 있는 프로그램. 오프소스이며, 기반이되는 프로그램들도 오픈소스프로젝트 프로그램들임. MicroArray특성상 여러번의 실험을 하고, 다른 실험결과들 까지 다루게 되면 관리도 어려워질뿐만아니라 의미있는 데이터를 찾기가 어려워진다고.. 이럴때 필요한 프로그램.
BaseInstall -- 우분투에 BASE 설치하기.
[http://opensource.microarray.omrf.org/wiki/bin/view/BASE/BASEdBUsersGuide UsersGuide]
http://www.lcb.uu.se/baseplugins.php -- R과 연동이 가능한 plug-in을 제공
[terra19]님이 제게 알려주셨습니다. 약간 살펴봤는데, 상당히 많은 기능이 있는거 같습니다. -- ["cyppi"] DateTime(2005-07-25T08:04:47Z)
제가 실험실에 셋팅하고자 하는 시스템의 벤치마커로 생각하고 있습니다. -- ["terra19"]
Tips
1. plug-in의 application software가 실행되지 않을때
vi /usr/local/base/config.inc.php $config["mysql.localinfile"]=0;에서 0을 1로 바꾼다. /usr/local/base/bin/base.server start
2. reporter format이나 result file format의 column내용을 변경하고 싶을 때
: install을 하기 전에 base/include/local을 보면 raw_colums.inc.php와 repoter_columns.inc.php가 있는데, result file은 raw_colums.inc.php를 reporter format은 reporter_columns.inc.php의 내용을 보고 변경을 한 후 install을 수행한다.