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관련프로그램 * ExcelMicrosatelliteToolkit |
ShortTandemRepeat Short_tandem_repeat = Microsatellite
DNA Profiling 에 사용될 수 있는 VNTR의 한가지로 대표적인 GeneticVariation의 하나이다. 길이는 2~10반복이다.
다음과 같은 이유들로 QTL탐색 및 유전자지도작성을 위한 GeneticMarker로 각광받고 있다.
Gene의 전반에 걸쳐 많이 나타난다.
- 고도의 다형성을 가진다.
- 유전자에 무작위로 분포한다.
- 공우성(co-dominance) 유전양식을 따른다.
해당 Locus의 서열분석작업 자동화가 쉽다.
현재 HumanGenome에서 3000여개 이상의 MicroSatellite marker가 분리 및 등록되었다. 그 Gene의 Locus는 STS로 결정하여 YAC의 인접지도등의 물리 지도 작성에 이용한다. 모든 MicroSatellite marker의 정보는 GDB등에서 얻을 수 있다.
미국 CODIS 에서 개인식별에 사용하는 13개의 STR은 다음과 같다.
관련프로그램